Voici la correction du problème de la semaine 33 … Je sais on est plus du tout la semaine 33 mais bon, mieux vaut tard que jamais, et à vrai dire, je comptais sur nikopole pour poster sa réponse comme ça j’aurais moins eu à me fatiguer ^^

1) Virologie fondamentale

a)Définir le terme « virus ». Donnez 3 exemples de familles de virus. Quelle est la différence entre virus et virion ?
Le terme “Virus” désigne une famille de particule biologique infectieuse capable de détourner la machinerie cellulaire à son avantage dans le but de se reproduire. En ce sens c’est un parasite cellulaire.

Le virus est autant la particule virale que le matériel génétique que l’on trouvera dans la cellule après pénétration. Le virion désigne la particule virale libre.

b) Donnez les éléments permettant de caractériser un virus. Exemple : ARN/ADN
Les différents virus peuvent être caractérisés et reconnus entre eux : leurs caractéristiques divergent. Le virologue averti sera capable d’identifier un virus grâce à l’observation attentive d’un seul virion. Bien sûr, il lui faudra quelques éléments complémentaires pour confirmer son intuition.
On peut donc compter dans les caractéristiques permettant de différencier différents virus : leur morphologie et la symétrie de leur capside (qui peut être hélicoïdale, cubique, ou complexe), la nature de leur matériel génétique (ARN, ADN ? Présence d’une transcriptase inverse ? Simple brin, double brin ? Polarité négative ou positive pour les génomes à ARN ? ou encore génome circulaire ou linéaire ?), et la présence ou non d’une enveloppe (bicouche de lipides provenant de la cellule hôte avant la sortie du virion et contenant des protéines virales).

c) Combien de structures de capsides sont connues ? Donner un exemple pour chaque type de structure capsidiale.
Comme dit précédemment, il existe 3 types de structures capsidiales : cubique (ou icosaédrique), hélicoïdale ou complexe.
Un virus à structure capsidiale cubique : HSV ou Herpes Simplex Virus de la famille des Herpesviridae
Un virus à structure capsidiale hélicoïdale : EBOV ou Ebola Virus de la famille des Filoviridae
Un virus à structure capsidiale complexe : Variola Virus ou Virus de la variole humaine, de la famille des Poxviridae.
Ces trois virus sont des virus très importants de par les pathologies qu’ils causent, et de par les problèmes de santé publique qu’ils causent, ont causés, ou pourraient à nouveau causer. L’OMS estime que le Virus de la variole humaine est éradiqué … mais nous en gardons néanmoins dans de (trop ?) nombreux laboratoires.

d) Historiquement, comment s’effectuait la « culture virale » ? (2 réponses possibles).
La réponse classique à cette question serait la culture sur oeuf de poule embryonné (fécondé). On peut néanmoins noter qu’il existe une alternative : la culture sur animal de laboratoire … Vous voulez étudier le virus de la variole du singe … Vous n’avez qu’à infecter un singe avec.

2) Virologie appliquée à la pathologie humaine

a) A quoi ces symptômes vous font-ils penser ?
L’état de confusion mentale, la réduction de l’acuité visuelle, ainsi que l’ataxie doivent mettre le praticien en état d’alerte : nous sommes en présence d’une urgence médicale. Ces symptômes, associés à une fièvre aigüe, suffisent à faire penser à une atteinte d’origine infectieuse du système nerveux central : méningite, encéphalite. Il est urgent d’effectuer une IRM ou à défaut, un scanner.
S’il y a un truc dont on doit se souvenir dans cet exercice, c’est celui là … Ce ne sont pas des symptômes que l’on peut se permettre de prendre à la légère. Si vous, ou quelqu’un que vous connaissez présente ces symptômes, appelez une ambulance.

b) Qu’est-ce qu’une IRM. Sur quel principe physique repose l’IRM. Définir les termes hypersignal et hyposignal.
Une IRM, ce n’est rien. On peut parler d’appareil à IRM, on peut parler de cliché par IRM. IRM est un acronyme signifiant Imagerie par Résonance Magnétique. C’est une machine basée sur le principe de la résonnance magnétique nucléaire (Plus d’infos / Wikipedia). Un hyposignal, comme son nom l’indique, est un signal plus bas que le signal que l’on relève autour. Il se révèle par zone plus claire à l’image. Un hypersignal est quand à lui une zone où le signal est plus fort. Il se révèle par une zone plus sombre à l’image.

c) Cette IRM confirme-t-elle vos suspicions ?
Sur cette IRM, nous voyons bien que l’encéphale est atteint, de manière bilatérale. Il s’agit donc d’une encéphalite. Nos suspicions, dans ce corrigé sont donc confirmées, les vôtres … je n’en sais rien.

d) Définir protéinorachie, cellulorachie, et interféron. Que nous apprennent ces analyses ? Qu’est ce que l’aciclovir. Dans quel cas l’utilise-t-on ?
Les termes protéinorachie et cellulorachie désignent respectivement la concentration en protéine du liquide céphalo-rachidien (LCR, aussi appellé liquide cérébro-spinal) et le nombre de cellules présentes dans ce même LCR. Il faut savoir que la composition du LCR est finement régulée par des cellules spécialisées : les épendymocytes. Il est produit dans le cerveau et remplis les lacunes de celui-ci (appelées ventricules). Il irrigue également le canal épendymaire de la moëlle épinière.
L’interféron est une famille de protéine permettant la médiation et la modulation de l’immunité. Il est souvent un marqueur d’infection virale. Ces analyses nous apprennent que l’infection est le plus probablement virale (aspect clair, interferon, lymphocytes élevés, IgM).
L’aciclovir est un médicament de la famille des antiviraux. Il est utilisé en traitement de première intention de contre le virus de l’herpès (HSV). En effet, celui-ci peut provoquer des encéphalites dites encéphalites herpétiques. Celles-ci sont les plus courantes des encéphalites virales en France.

e) Proposez quelques familles d’agents pathogènes capables de provoquer ces symptômes.
Si réponse il y avait eu, cette question aurait été la plus simple … il suffisait de lire la suite. HSV, EBV, VZV, CMV, Grippe, Entérovirus, Arbovirus, Papovirus et Flavivirus.

f) Quel était le virus responsable de cette infection ? Existe-t-il un traitement ? Détaillez les infections dues à ce virus.
Ici, les autres agents pathogènes ayant été écartés, il s’agissait d’un Flavivirus. Il en existe 3 causant des encéphalites : le virus du Nil occidental (West-Nile Virus), le virus de l’encéphalite de St-Louis, et le virus de l’encéphalite Japonaise. Ils sont tout trois transmis par des moustiques. Nous pouvons écarter le virus de l’encéphalite de St-Louis, celui-ci étant peu fréquent aux états unis, et absent en Europe. Nous pouvons également écarter le virus de l’encéphalite japonaise … celui ci ne se retrouvant qu’en Asie. Le West-Nile Virus est donc le seul encore en course. Il a été signalé des épidémies en Camargue (notre patient n’est-il pas parti à Arles ?) et en Corse. Il n’existe aucun traitement. Pour la suite de la question, vous pouvez consulter cette page : West-Nile Virus / Wikipedia (fr) ou (en)